L'apôtre de district Kraus du Canada reçoit la mission de faire connaître l'Eglise néo-apostolique au Burkina Faso et fonde les premières communautés en 1983. C'est le début d'une évolution extrêmement bénie. De nombreuses personnes dans le pays trouvent dans l'Eglise néo-apostolique leur berceau spirituel. Dans les années 1990, l'apôtre Wuaku est le premier apôtre africain à être ordonné pour le Burkina Faso.

Le soutien administratif et pastoral et du pays est confié en 2001 à l'Eglise néo-apostolique d'Allemagne. L'apôtre Louis Mendy a été ordonné en 2007 et les apôtres René Lompo et Fimba Lompo, actuellement en fonction, en 2017. Il sont assistés par l'apôtre Gert Opdenplatz d'Allemagne.